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三維分子類

RASMOL 2.7.5.2	觀看生物分子3D微觀立體結(jié)構(gòu)的軟件。
RasTop 2.2	為RasMol的圖形用戶界面軟件，免費(fèi)，簡化RASMOL的使用。
DS Visualizer 4.1	3維分子瀏覽工具，30天試用版，功能也十分強(qiáng)大。
ICM-Browser 3.8-3	3維分子瀏覽工具，并具有序列比對(duì)顯示功能，免費(fèi)推出。
ActiveICM 1.2-2	可在Office軟件和瀏覽器中顯示查看三維ICM分子圖片文件軟件。
VMD 1.9.2 beta 1	用來顯示生物分子的微觀立體結(jié)構(gòu)，更棒的功能是可以利用內(nèi)建的功能，做出動(dòng)畫效果。
CN3D 4.3.1	See in 3D的縮寫。允許你在線作為客戶端可視并交互地觀察NCBI Entrez數(shù)據(jù)庫的立體蛋白序列。
WPDB 2.2	美國國家計(jì)算機(jī)科學(xué)與工程學(xué)實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的基于Windows的PDB文件查詢與處理分析軟件。
DTMM 4.2 Demo	是一個(gè)簡單易用的3維分子模型顯示、編輯與構(gòu)建程序。
POV-Ray 3.7	是一個(gè)高質(zhì)量、完全免費(fèi)創(chuàng)造最棒三維圖像的非常有名的工具。
MegaPov 1.2.1	是Pov-Ray非官方編譯版本，三維渲染效果更好。需要安裝Pov-Ray。
Mol2Mol 5.6.3 Demo	主要用來進(jìn)行各種分子文件的轉(zhuǎn)換，支持30種主要分子格式，也可以用來進(jìn)行3維分子的簡單顯示。
MolPOV 2.1.0	MolPOV是PDB格式至POV格式轉(zhuǎn)化工具。
PovChem 2.1.1	免費(fèi)軟件，注冊(cè)碼：APyUrblJnYZr，將PDB格式分子文件轉(zhuǎn)化為POV格式，再使用POV-Ray v3.1g進(jìn)行3D加工。
ORTEP-III 2014.1	用來生成分子的熱橢圓形點(diǎn)圖。
PWT(PLATON for Windows Taskbar) 1.17	PLATON是通用結(jié)晶學(xué)軟件工具。
Mage 6.47	讀取并演示Kinemage格式文件的專用軟件。
Prekin 6.51	將PDB格式文件轉(zhuǎn)換為對(duì)應(yīng)的kinemage格式的專用軟件。
KiNG 2.21	(Kinemage, Next Generation)的縮寫。三維分子Kinemage的顯示軟件。
Swiss-PdbViewer 4.1	是一個(gè)界面非常友好的同時(shí)分析幾個(gè)蛋白PDB文件。
StrukEd Demo	化學(xué)分子編輯與三維模型生成軟件StrukEd Demo。
JMVS 4 041122版	Java3D Molecular Visualisation System 的縮寫，使用JAVA技術(shù)編寫的三維分子查看器。
Re_View 1.0	為讀取及分析XYZ格式三維分子文件的軟件。
Oscail 2015	用來處理、定義與檢查小分子單晶的軟件包。
Moilin 2015	分子構(gòu)建與觀察軟件，是Tinker軟件的Windows界面程序。
Tinker 7.0.1	分子設(shè)計(jì)建模軟件，可使用許多常用參數(shù)集。
Biodesigner 0.75	免費(fèi)的分子建模與顯示軟件，支持多種三維分子格式。
MoluCAD 1.034 Demo	分子建模與顯示工具軟件演示版。
Protein Explorer 2.80	顯示蛋白和核酸等大分子三維結(jié)構(gòu)的免費(fèi)瀏覽器插件，是RASMOL衍生出的軟件，速度快。
Chimera 1.10.1	免費(fèi)的交互式分子模型顯示程序。
Jmol 14.2.12	java語言寫成的開放源代碼的免費(fèi)三維分子顯示程序。
Ramachandran Plot Explorer 1.0	蛋白分子顯示軟件。
ProteinScope LE 1.0.5	免費(fèi)PDB蛋白三維顯示軟件，需要系統(tǒng)支持 DirectX 9.0b。
CHIME 2.6 SP8	IE與NetScape瀏覽器插件,安裝后,可以直接用瀏覽器觀看PDB格式的文件。
YASARA View 14.12.2	是免費(fèi)分子顯示軟。
NOC 3.01	免費(fèi)的蛋白3維結(jié)構(gòu)構(gòu)建、顯示、分析軟件。
3DNA 2.1 20141222	分析、構(gòu)建、顯示核酸三維結(jié)構(gòu)的軟件。軟件需要Cygwin環(huán)境。
ArgusLab 4.0.1	分子構(gòu)型、繪圖和藥物設(shè)計(jì)軟件。
CueMol 2.2.1.330	免費(fèi)的分子結(jié)構(gòu)顯示和三維渲染軟件。
jimp 2 0.091	顯示三維分子軟件。
SweetMollyGrace 1.3	三維分子渲染與動(dòng)畫軟件�？勺x取各種三維格式的文件。
Facio 18.8.2	三維分子建模、顯示與量子化學(xué)計(jì)算程序。
VEGA ZZ 3.0.5.12	支持多種三維格式并可進(jìn)行顯示、計(jì)算、分析的免費(fèi)軟件。
GDIS 0.99	三維分子顯示軟件。
PDBlib 2.2	顯示PDB文件的C++庫，可用于編程。
Ascalaph 1.8.88	三維分子顯示軟件和分子設(shè)計(jì)建模軟件。
QuteMol 0.4.1	開源的三維分子顯示軟件。
BALLView 1.4.2	分子三維建模、顯示軟件
bioeditor 1.6.1 BioViewer 1.5.7	三維分子結(jié)構(gòu)編輯軟件和三維分子結(jié)構(gòu)顯示軟件
ProteinShader beta 0.9.4	蛋白三維分子顯示渲染工具
PDB Editor 090203	界面友好的PDB文件編輯器
Zodiac 0.65	用于藥物設(shè)計(jì)的分子三維建模軟件包
Avogadro 2.0.7.2	免費(fèi)三維分子編輯器。
Bioclipse 2.6.1	生物信息學(xué)分子顯示平臺(tái)。
ANTHEPROT 3D 1.0.162	蛋白三維結(jié)構(gòu)查看軟件。
Chemis3D 2.89b	三維分子網(wǎng)頁顯示Java小程序。
Chemitorium 4.0	三維分子分析與現(xiàn)實(shí)工具軟件。
LigandScout 3.12	用三維模型高分子 / 配合物構(gòu)建藥效團(tuán)模型結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)工具軟件。
AutoDock 4.2.6	小分子三維建模軟件。
Benchware 3D Explorer 2.7	三維分子顯示分析軟件。
PyRx 0.9.1	三維分子藥物輔助設(shè)計(jì)軟件。
VisProt3DS 3.03	觀察蛋白質(zhì)和DNA分子PDB結(jié)構(gòu)軟件。
OpenAstexViewer 3.0	三維顯示Java插件。
COSMOS 5.0 PRO trial COSMOS Viewer 3.0	三維分子分析、建模、顯示軟件。免費(fèi)的三維顯示軟件。
MOIL 12.0.3923	免費(fèi)分子模型建模軟件。
OpenMM 6.2.0	分子三維建模程序庫。
OpenStructure 1.3.3	開源結(jié)構(gòu)生物學(xué)軟件。
MMPRO 0.7	分子顯示分析軟件。
CMView 1.1.1	大分子關(guān)聯(lián)圖(contact map)分析工具。
	以上軟件，除特別注明外，均在生物軟件dvd光盤1中。