K-Estimator is a program to estimate the number of synonymous (Ks) and nonsynonymous substitutions (Ka) per site and the confidence intervals by Monte Carlo simulations.
當對兩個核酸序列進行比對時，K-Estimator用來評估兩者核苷酸替代數(shù)（趨異性），包括蛋白編碼區(qū)與非蛋白編碼區(qū)。使用Monte Carlo模擬估算可信區(qū)間。在分子進化研究中，評估兩條核酸序列的被替換核苷酸數(shù)量是一個中心課題。精確量化這些數(shù)據(jù)將直接影響廣泛應用于進化基因學的許多實驗的可靠性。對蛋白編碼區(qū)，分為兩種情況，一種是核苷酸替換不造成氨基酸改變，稱為同義替代（synonymous)，另一種情況為核苷酸替換造成氨基酸改變，稱為非同義替代（nonsynonymous)，必須分別評估這種核苷酸替代數(shù)量。每個位點同義替代數(shù)量用Ks表示，非同義替代數(shù)量用Ka表示。對非蛋白編碼區(qū)，總替代數(shù)為K。K-Estimator 便是用來計算K.Ka,Ks及可信區(qū)間的應用軟件。
